A história de Filhos de Tupã resulta de extensa pesquisa bibliográfica a respeito da etnia goitacá e seu conflito com a expedição colonizadora de Vasco Fernandes Coutinho,na Capitania do Espírito Santo. Os goitacás foram descritos pelos primeiros colonos como sendo os indígenas mais fortes e ferozes do Novo Mundo. Sua estatura era maior, eram hábeis nadadores e corredores, e dizia-se até que matavam tubarões com as próprias mãos para incrustar seus dentes nas pontas de suas flechas. Eles demonstraram a notável habilidade de expulsar os portugueses de seu território em mais de uma ocasião, mesmo enfrentando uma imensa desvantagem bélica. A estrutura do livro alterna-se entre o ponto de vista dos goitacás e dos seus antagonistas colonizadores. A narrativa tem início com a história de Uerê, filho do cacique goitacá, que precisa lidar com conflitos sangrentos com outras etnias inimigas, enquanto no horizonte começam a surgir rumores e sinais de que uma ameaça maior está para surgir. E vem de caravelas. Cada capítulo baseia-se em um contexto histórico específico, até culminar, irremediavelmente, no grande conflito que ficou conhecido como A Batalha do Cricaré.